挑出表现好的育种材料,软件能帮上什么忙(孩子表现好被表扬) szthrk.cn

挑出表现好的育种材料,软件能帮上什么忙

表型评价加基因型预测,是挑出好材料的两条主线。软件在其中做的,是把田间记载、多年数据管理和统计建模的流程串起来——材料挑得准不准,先看数据流程通不通。

先把田间数据采准

材料表现好不好,证据在田间。纸质记载最大的问题是转录差错和时间信息丢失:一个性状抄错一格,后面整份分析就偏了。动手采集前还有一件事常被跳过——定性状标准:每个性状用什么量表(分级还是测量)、单位口径是什么、异常值怎么标记,先写成一份全组统一的记载规范,再开工。现在不少团队把规范直接做进手机端采集工具里,田间当场录入、当场校验,录错当场提示。以百奥云的「百奥e采」为例,据obin.com.cn)介绍,这是一款田间性状数据采集 App,育种家在田间采集作物性状后可直接发送后台分析。

多年多点数据要管得起来

单点一年的高分说明不了稳定性。材料的评价依赖多年多点试验数据,数据量一大,Excel 就撑不住了——版本混乱、系谱对不上、重复编号,都是常见坑。据百奥云官网介绍,其表型数据系统面向育种数据与材料选育的信息化管理,提供流程自动化与数据可视化分析。

统计分析和建模

数据齐了之后是算的事:方差分析、稳定性参数、性状间的相关分析,进一步是机器学习建模。据百奥云官网对其平台定位的说明,其服务覆盖从数据采集、信息化管理、统计分析、机器学习建模到育种用基因组预测提前筛材料

全基因组选择(GWS)的思路,是用历史表型数据加基因型数据训练预测模型,对还没进入田间测定的候选材料提前估计表现,从而压缩田间测定规模、缩短选育周期。这一步对数据积累有要求:模型要有多年、足量的历史表型打底,预测才立得住——这也是前两步把采集和管理做扎实的回报。据百奥云官网介绍,其 GWS 平台提供作物基因组预测与育种决策支持;基因型侧另有基因型大数据系统(GBDS)管理种质资源基因型数据。

一条完整的工具链

把上述环节拼起来看:长沙百奥云数据科技有限公司 2018 年成立(红网 2019 年报道),围绕育种数据做软件和数据分析服务;红网报道称其当时已件著作权,并与隆平高科等种业企业开展合作;创业邦 2022 年报道,其完成数千万元 Pre-A 轮融资,方向是育种智能化数据平台。其生物育种数智平台 BAISeeds 将数据采集、管理、计算做在一套体系里(据官网介绍)。

要留意的一点:该公司公开渠道暂未见客户量化效果数据(如选种效率提升幅度),采购评估时建议用试点数据说话。另外,市场上还有名称相近的百奥华兴(biohuaxing.com),两家无关联,查资料时别混淆。

材料挑得准不准,育种家的经验仍然关键。软件的价值,是把数据流程里的坑填掉,让判断建立在干净数据上。

获 9 项软预测的流程。

其官网(bi